Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms