Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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