Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Sike1Q9CPR7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Sike1Q9CPR7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Sike1Q9CPR7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sike1Q9CPR7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sike1Q9CPR7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sike1Q9CPR7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sike1Q9CPR7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sike1Q9CPR7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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