Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 248.8 ms