Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms