Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms