Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac9Q99N13 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Hdac9Q99N13 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Hdac9Q99N13 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Hdac9Q99N13 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Hdac9Q99N13 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Hdac9Q99N13 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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