Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms