Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Cldn16Q925N4 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Cldn16Q925N4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Cldn16Q925N4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cldn16Q925N4 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Cldn16Q925N4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
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Cldn16Q925N4 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Cldn16Q925N4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Cldn16Q925N4 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Cldn16Q925N4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn16Q925N4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn16Q925N4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn16Q925N4 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn16Q925N4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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Cldn16Q925N4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn16Q925N4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn16Q925N4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn16Q925N4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn16Q925N4 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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Cldn16Q925N4 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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