Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Sf3b5Q923D4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms