Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip1Q922J3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms