Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rhbdd2Q8VEK2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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