Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Smg8Q8VE18 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Smg8Q8VE18 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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