Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rdh10Q8VCH7 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Rdh10Q8VCH7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Rdh10Q8VCH7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Rdh10Q8VCH7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rdh10Q8VCH7 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rdh10Q8VCH7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rdh10Q8VCH7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rdh10Q8VCH7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rdh10Q8VCH7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rdh10Q8VCH7 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rdh10Q8VCH7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rdh10Q8VCH7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rdh10Q8VCH7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rdh10Q8VCH7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms