Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r72Q8K3N7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms