Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OptnQ8K3K8 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms