Protein–RNA interactions for Protein: Q8K215

Lyrm4, LYR motif-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyrm4Q8K215 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lyrm4Q8K215 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms