Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lrit1Q8K099 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lrit1Q8K099 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lrit1Q8K099 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lrit1Q8K099 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lrit1Q8K099 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lrit1Q8K099 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lrit1Q8K099 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lrit1Q8K099 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lrit1Q8K099 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lrit1Q8K099 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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