Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms