Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntrobQ8CB62 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntrobQ8CB62 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CntrobQ8CB62 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntrobQ8CB62 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntrobQ8CB62 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntrobQ8CB62 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntrobQ8CB62 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntrobQ8CB62 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 585.8 ms