Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnot2Q8C5L3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms