Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Trim35Q8C006 Gm45047-201ENSMUST00000207651 309 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Trim35Q8C006 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Trim35Q8C006 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Trim35Q8C006 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Trim35Q8C006 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trim35Q8C006 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm29537-202ENSMUST00000186153 1498 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trim35Q8C006 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trim35Q8C006 Gm36569-201ENSMUST00000195082 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trim35Q8C006 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm10015-201ENSMUST00000072570 465 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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