Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ctdsp2Q8BX07 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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