Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc30Q8BVF4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc30Q8BVF4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc30Q8BVF4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc30Q8BVF4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc30Q8BVF4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc30Q8BVF4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc30Q8BVF4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms