Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIS1

Zfp9, Zinc finger protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp9Q8BIS1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp9Q8BIS1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp9Q8BIS1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp9Q8BIS1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp9Q8BIS1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp9Q8BIS1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp9Q8BIS1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp9Q8BIS1 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp9Q8BIS1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp9Q8BIS1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms