Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.3Q85ZW6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms