Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChfrQ810L3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms