Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Pcsk9Q80W65 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Pcsk9Q80W65 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Pcsk9Q80W65 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Pcsk9Q80W65 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Pcsk9Q80W65 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Pcsk9Q80W65 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Pcsk9Q80W65 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Pcsk9Q80W65 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pcsk9Q80W65 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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