Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NischQ80TM9 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms