Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dsg1bQ7TSF1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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