Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap2lQ7TS74 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms