Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LcorQ6ZPI3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms