Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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