Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms