Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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