Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Msl2Q69ZF8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Msl2Q69ZF8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms