Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkp4Q68FH0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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