Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tfe3Q64092 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms