Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BcanQ61361 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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BcanQ61361 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BcanQ61361 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BcanQ61361 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BcanQ61361 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BcanQ61361 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms