Protein–RNA interactions for Protein: Q60766

Irgm1, Immunity-related GTPase family M protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm1Q60766 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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Irgm1Q60766 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Irgm1Q60766 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Irgm1Q60766 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Irgm1Q60766 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Irgm1Q60766 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irgm1Q60766 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms