Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf3Q60765 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms