Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mkrn3Q60764 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms