Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnk2a1Q60737 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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