Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms