Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms