Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms