Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34b4Q3V0X2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms