Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp48Q3V0C5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp48Q3V0C5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp48Q3V0C5 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp48Q3V0C5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp48Q3V0C5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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