Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms