Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Arfgef3Q3UGY8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Arfgef3Q3UGY8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms